Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arap1Q4LDD4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Arap1Q4LDD4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arap1Q4LDD4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms