Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3lQ4KL14 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3lQ4KL14 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms