Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem40Q4FJU9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem40Q4FJU9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms