Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc185Q3V118 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Ccdc185Q3V118 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc185Q3V118 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc185Q3V118 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms