Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc43Q3V0L5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc43Q3V0L5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc43Q3V0L5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms