Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc27Q3V036 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc27Q3V036 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms