Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E330034G19RikQ3UWX6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms