Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga4Q3UW12 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga4Q3UW12 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms