Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn4Q3UV66 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms