Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms