Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BB287469Q3UT53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms