Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UPC7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3UPC7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3UPC7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3UPC7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3UPC7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3UPC7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UPC7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UPC7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UPC7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UPC7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms