Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln5Q3UMW8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Cln5Q3UMW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln5Q3UMW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln5Q3UMW8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cln5Q3UMW8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cln5Q3UMW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln5Q3UMW8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms