Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctsll3Q3ULP7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctsll3Q3ULP7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms