Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp19Q3UJD6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms