Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf224Q3UIW8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf224Q3UIW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms