Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc34Q3UI66 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc34Q3UI66 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms