Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp36Q3UFY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp36Q3UFY0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms