Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnft2Q3UF64 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft2Q3UF64 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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