Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trafd1Q3UDK1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms