Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll12Q3UDE2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms