Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf180Q3U827 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf180Q3U827 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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