Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtpbp6Q3U6U5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Gtpbp6Q3U6U5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp6Q3U6U5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms