Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
YrdcQ3U5F4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
YrdcQ3U5F4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms