Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VwceQ3U515 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VwceQ3U515 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms