Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp4Q3U4B1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms