Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hectd3Q3U487 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hectd3Q3U487 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms