Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U1D9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U1D9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms