Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Tbc1d2bQ3U0J8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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