Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkl4Q3TZA2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl4Q3TZA2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms