Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc28Q3TX51 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc28Q3TX51 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms