Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccndbp1Q3TVC7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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