Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Ccdc136Q3TVA9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc136Q3TVA9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms