Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc4Q3TR08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc4Q3TR08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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