Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Calr4Q3TQS0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Calr4Q3TQS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr4Q3TQS0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms