Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc102aQ3TMW1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc102aQ3TMW1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms