Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc13Q3TIR1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms