Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3KNL4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3KNL4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms