Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M3Q31093 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M3Q31093 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms