Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vax1Q2NKI2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms