Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrp1aQ2LKU9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms