Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
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Shroom4Q1W617 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms