Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd300lgQ1ERP8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd300lgQ1ERP8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd300lgQ1ERP8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms