Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap25Q1EHW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap25Q1EHW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms