Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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