Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q149G0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q149G0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q149G0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q149G0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q149G0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q149G0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms