Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rpusd2Q149F1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rpusd2Q149F1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rpusd2Q149F1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rpusd2Q149F1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rpusd2Q149F1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rpusd2Q149F1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rpusd2Q149F1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms