Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms