Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc162pQ0VG85 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms