Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r181Q0P547 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r181Q0P547 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r181Q0P547 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r181Q0P547 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms